Учёные оценили количество бактерий с генами устойчивости к антибиотикам в сточных водах Москвы

Плохо контролируемое и нерациональное использование антибиотиков в медицине, ветеринарии и сельском хозяйстве приводит к распространению бактериальных штаммов, устойчивых к антибиотикам, в том числе обладающих множественной лекарственной устойчивостью. Это, в свою очередь, препятствует эффективному лечению инфекционных болезней у людей и сельскохозяйственных животных и может стать причиной эпидемий. Один из основных источников устойчивых к лекарствам бактерий — это сточные воды, поскольку в них попадает большинство антибиотиков, не усвоенных и выведенных из организма естественным образом. Более того, очистные сооружения, в которые поступают сточные воды, оказываются «горячими точками» для формирования устойчивых штаммов, потому что здесь микробы, способные обмениваться генетическим материалом, передают друг другу гены антибиотикорезистентности.

Учёные из Федерального исследовательского центра «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН (Москва) исследовали содержание генов устойчивости к антибиотикам в общем генетическом материале микроорганизмов сточных вод Москвы до и после их очистки. Московские очистные станции ежедневно обрабатывают около 6 миллионов кубометров воды, и очищенные сточные воды сбрасываются в реку Москва, составляя половину её стока. В исследовании авторы изучили две крупные станции из комплекса Люберецких очистных сооружений АО «Мосводоканал», ответственные за обработку городских сточных вод.

В первую очередь биологи сравнили видовой состав микробных сообществ в сточных водах до и после очистки. Оказалось, что микроорганизмы — фекальные загрязнители и потенциальные патогены — удаляются на очистных сооружениях Москвы с высокой эффективностью: их концентрация в воде после очистки снижается в десятки тысяч раз.

Затем авторы проанализировали весь генетический материал, содержащийся в московских сточных водах. Это позволило выявить бактериальные гены, отвечающие за устойчивость к антибиотикам. В необработанных сточных водах исследователи обнаружили несколько сотен генов, способных обеспечить устойчивость к наиболее широко используемым классам антибиотиков: бета-лактамам, к которым относится пенициллин, макролидам (например, эритромицину), аминогликозидам (например, гентамицину), тетрациклинам (например, доксициклину), сульфаниламидам (например, стрептоциду) и четвертичным аммониевым соединениям, используемым в средствах для дезинфекции.

Учёные рассчитали, что в среднем в неочищенной московской сточной воде на один бактериальный геном (то есть условно на одну бактерию) приходится 1–2 гена устойчивости к антибиотикам, тогда как после обработки воды их доля в общем генетическом материале бактерий снижается примерно в 3–4 раза. Тем не менее, даже в прошедшей все стадии очистки сточной воде были обнаружены гены устойчивости ко многим широко используемым антибиотикам. Ни одни очистные сооружения мира не способны полностью удалить эти генетические последовательности из сточных вод, и, согласно литературным данным, эффективность очистки в Москве сопоставима с мегаполисами других европейских стран.

Шахжахон Бегматов, руководитель проекта, научный сотрудник лаборатории геномики микроорганизмов и метагеномики института биоинженерии ФИЦ Биотехнологии РАН. Источник: Шахжахон Бегматов

«Мы получили только первые данные о том, какие гены лекарственной устойчивости поступают в реку Москва со сточными водами. На следующем этапе мы сравним содержание устойчивых к антибиотикам бактерий и генов устойчивости в реке Москва в разных точках выше и ниже по течению от города, чтобы выявить источники загрязнения. Мы проанализируем метагеном речной воды ниже по течению реки, вплоть до места её впадения в Оку, чтобы посмотреть, насколько эффективна самоочистка речной воды», — рассказывает руководитель проекта, поддержанного грантом РНФ, Шахжахон Бегматов, кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории геномики микроорганизмов и метагеномики института биоинженерии ФИЦ Биотехнологии РАН.